Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smarcad1Q04692 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms