Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcr5Q04683 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms