Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scg2Q03517 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg2Q03517 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg2Q03517 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg2Q03517 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scg2Q03517 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg2Q03517 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg2Q03517 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Scg2Q03517 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg2Q03517 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scg2Q03517 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Scg2Q03517 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scg2Q03517 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scg2Q03517 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg2Q03517 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg2Q03517 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg2Q03517 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scg2Q03517 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg2Q03517 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg2Q03517 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scg2Q03517 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scg2Q03517 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms