Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PrkczQ02956 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms