Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col6a2Q02788 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col6a2Q02788 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms