Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax5Q02650 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms