Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcqQ02111 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcqQ02111 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms