Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme2Q01768 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme2Q01768 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms