Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec23aQ01405 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23aQ01405 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms