Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HmgcrQ01237 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms