Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2cQ01098 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms