Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HmmrQ00547 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms