Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PgrQ00175 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms