Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms