Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brca2P97929 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brca2P97929 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brca2P97929 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brca2P97929 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brca2P97929 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms