Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama4P97927 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama4P97927 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama4P97927 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama4P97927 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama4P97927 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama4P97927 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms