Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cry1P97784 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cry1P97784 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cry1P97784 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms