Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms