Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx3-1P97436 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx3-1P97436 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx3-1P97436 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms