Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig3P97386 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lig3P97386 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lig3P97386 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig3P97386 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig3P97386 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig3P97386 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms