Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-3P97334 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms