Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx3P81067 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx3P81067 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx3P81067 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx3P81067 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irx3P81067 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx3P81067 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms