Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx1P80205 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms