Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rad50P70388 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms