Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NficP70255 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NficP70255 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NficP70255 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NficP70255 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NficP70255 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NficP70255 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NficP70255 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NficP70255 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NficP70255 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NficP70255 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NficP70255 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NficP70255 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms