Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chl1P70232 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chl1P70232 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chl1P70232 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chl1P70232 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms