Protein–RNA interactions for Protein: P69744

Trpv5, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 5, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv5P69744 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv5P69744 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv5P69744 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms