Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UbdP63072 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UbdP63072 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UbdP63072 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UbdP63072 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UbdP63072 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UbdP63072 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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UbdP63072 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbdP63072 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbdP63072 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbdP63072 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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UbdP63072 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbdP63072 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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UbdP63072 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbdP63072 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UbdP63072 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbdP63072 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbdP63072 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UbdP63072 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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UbdP63072 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbdP63072 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbdP63072 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms