Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uba52P62984 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uba52P62984 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms