Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2lP62876 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2lP62876 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2lP62876 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2lP62876 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2lP62876 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms