Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms