Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snrpd2P62317 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms