Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps13P62301 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps13P62301 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps13P62301 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229 ms