Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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