Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms