Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abce1P61222 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abce1P61222 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abce1P61222 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Abce1P61222 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abce1P61222 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abce1P61222 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abce1P61222 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abce1P61222 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abce1P61222 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abce1P61222 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abce1P61222 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms