Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms