Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2kP61087 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms