Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm6sf1P58749 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tm6sf1P58749 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tm6sf1P58749 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms