Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms