Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TdgP56581 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TdgP56581 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TdgP56581 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TdgP56581 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TdgP56581 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TdgP56581 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TdgP56581 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TdgP56581 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TdgP56581 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TdgP56581 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TdgP56581 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TdgP56581 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TdgP56581 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TdgP56581 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TdgP56581 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TdgP56581 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TdgP56581 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TdgP56581 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TdgP56581 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TdgP56581 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TdgP56581 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TdgP56581 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TdgP56581 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms