Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc1a3P56564 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms