Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms