Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf5P56477 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irf5P56477 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf5P56477 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf5P56477 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf5P56477 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf5P56477 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms