Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CdaP56389 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CdaP56389 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CdaP56389 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CdaP56389 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CdaP56389 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CdaP56389 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CdaP56389 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CdaP56389 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CdaP56389 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CdaP56389 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CdaP56389 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CdaP56389 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms