Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GferP56213 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GferP56213 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GferP56213 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GferP56213 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GferP56213 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms