Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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