Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtskP55097 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtskP55097 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtskP55097 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtskP55097 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtskP55097 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtskP55097 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtskP55097 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtskP55097 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtskP55097 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtskP55097 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtskP55097 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtskP55097 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtskP55097 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtskP55097 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtskP55097 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtskP55097 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtskP55097 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtskP55097 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtskP55097 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtskP55097 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtskP55097 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtskP55097 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtskP55097 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms