Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms