Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PctpP53808 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PctpP53808 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PctpP53808 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PctpP53808 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PctpP53808 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PctpP53808 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PctpP53808 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PctpP53808 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PctpP53808 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PctpP53808 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PctpP53808 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PctpP53808 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PctpP53808 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PctpP53808 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PctpP53808 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PctpP53808 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms